Биологи проследили раннюю историю ВИЧ в США

Изображение: ktsdesign / Фотодом / Shutterstock

Международная группа эволюционных биологов и генетиков из университетов США и Британии выяснила, что вирус ВИЧ-1 попал в США с Карибских островов в начале 1970-х.

Особенность вируса ВИЧ и главная проблема в борьбе с ним — высокая скорость мутации, которая привела в настоящий момент к появлению нескольких групп и подтипов вируса.

Так, в Северной Америке распространен вид ВИЧ-1 группы М подтипа B. Появление этой разновидности у североамериканских геев — ключевой поворотный пункт в развитии пандемии ВИЧ/СПИД в США. Филогенетические исследования уже заставили ученых предположить, что подтип B скрытно циркулировал в США в 1970-х, а на Карибских островах существовал еще раньше. Однако временные и географические координаты генома ВИЧ-1 (сейчас признано, что он уже существовал к 1981 году) оставались неясными, а ранние передвижения вируса по США — неизвестными.

Ученые провели серологические исследования более 2000 образцов сыворотки крови 1970-х годов и разработали высокочувствительный метод для восстановления вирусной РНК из архивных образцов. В результате представлено восемь полностью расшифрованных геномов из серальных образцов, взятых в США в 1978—1979 годах — это восемь из девяти самых старых образцов ВИЧ-1 группы М, которые удалось датировать.

По этим расшифрованным геномам ученые поняли, что в США ВИЧ-1 показал большое генетическое разнообразие в конкретный период — с 1969 по 1973 год. Также появилось четкое доказательство, что истоки этой эпидемии — в уже существовавшей ранее карибской эпидемии. Байесовский филогенетический анализ установил, что вирус попал в США в начале 1970-х и что вирус-предок с очень высокой вероятностью появился сначала в Нью-Йорке. Скорее всего, именно Нью-Йорк был ключевым центром ранней диверсификации вируса ВИЧ: вирус попал туда с Карибских островов, а не наоборот.

Ранее ученые восстановили геном ВИЧ-1 Гаэтана Дюга — человека, известного как «нулевой пациент», — и не обнаружили ни биологических, ни исторических свидетельств, что именно он был первичным носителем ВИЧ-1 подтипа B в США.

Статья опубликована в журнале Nature.

Ранее ученые выяснили историю происхождения вируса гепатита А.
Теги:

Читать еще на Чердаке: